Los efectos secundarios más comunes son el dolor en el lugar de la inyección (92%), fatiga (70%), cefalea (64.7%), mialgias (dolor muscular) (61.5%), artralgias (dolor articular) (46.4%), escalofríos (45.4%), náuseas/vómitos (23%), fiebre (15.5%) y el hinchazón en el lugar de la inyección (14.7%). Estas reacciones son mayoritariamente leves o moderadas y autolimitadas, y desaparecen unos días después de la vacunación. Estas reacciones son más comunes después de la segunda dosis y su frecuencia disminuye con la edad.
Además, han sido identificados/descritos casos muy raros de miocarditis y pericarditis (inflamación del músculo cardiaco o de la membrana que envuelve el corazón). Estos casos se producían fundamentalmente en el periodo de 14 días después de la vacunación, con mayor frecuencia después de la segunda dosis de la vacunación, y más comúnmente en los hombres jóvenes. Las miocarditis y pericarditis son leves en la mayoría de los casos y se resuelven con tratamiento y reposo.
También han sido descritas unas reacciones cutáneas tardías cerca del lugar de la inyección, que ocurren en torno al séptimo día (entre 2 y 12 días) después de recibir la vacuna, y han sido descritas como placas edematosas, pruriginosas y dolorosas. Esta reacción puede aparecer más temprano después de la administración de la segunda dosis. Normalmente se resuelven en unos 5 días, pero en algunos casos persisten hasta 21 días. Sin embargo, esta reacción después de la primera dosis no es una contraindicación para la administración de la segunda dosis.
Los casos de anafilaxia tras las vacunas ARNm frente a la COVID-19 son muy raros - actualmente se estima que ocurren en 2.5 a 11.1 casos por 1 millón de dosis, fundamentalmente en las personas con antecedentes de alergia. La anafilaxia es tratable si se detecta precozmente y se trata de inmediato. Si alguna persona tiene una reacción alérgica severa después de recibir la primera dosis de la vacuna ARNm frente a la COVID-19 (tanto Pfizer-BioNTech como Moderna), esta persona no puede recibir otra dosis de esta misma vacuna.
Actualización (Marzo del 2023):
La reactogenicidad y el perfil de eventos adversos observados después de la dosis de refuerzo fueron generalmente similares a los observados después de la segunda dosis de la serie primaria de 2 dosis, lo que sugiere que no hay potenciación de la reactogenicidad ni ninguna nueva señal de seguridad que surja de la administración de una tercera dosis.